BibTex RIS Kaynak Göster

Determination of Genetic Diversity among Phaseolus vulgaris (Leguminosae) Populations Collected from Konya Region by SDS-PAGE

Yıl 2010, Cilt: 2 Sayı: 35, 59 - 64, 01.12.2010

Elif Gülbahçe Buğra Özkubat Emine Arslan

Öz

This study aimed to determine the genetic diversity among 17 Phaseolus vulgaris populations collected from districts of Konya by SDS-PAGE. Seed storage protein profiles were scored visually as present (1) or absent (0). In all, 37 polypeptide bands of different sizes ranging from 14.4 to ~135 kDa were observed in the 17 Phaseolus vulgaris populations. Cluster analysis was performed using the UPGMA in Bio 1 D ++ computer program. Similarity among genotypes was estimated basing on Nei’s homology and a dendrogram was obtained. According to dendrogram, 17 populations belonging to Phaseolus vulgaris were similar in rates ranging from 68 to 100 %. While the highest similarity was found between Kanada (Çumra) and Sarnıç (Altınekin) genotypes, the most distant genotype was Sarhoş (Washington) (Derbent).

Anahtar Kelimeler

Phaseolus vulgaris Genetic diversity SDS-PAGE Seed storage protein

Kaynakça

  • Babaoğlu, S., Açık, L., Çelebi, A., Adıgüzel, N. Molecular Analysıs Of Turkısh Alyssum L. (Brassıcaceae) Specıes By Rapd-Pcr And Sds-Page Methods. G.U. Journal of Science 17(3):25-33, (2004).
  • Beyazbenli, Ş., Dural, H., Arslan, E., Ertuğrul, K. Konya Bölgesindeki bazı Vicia L. (Leguminosae) Türlerinin Tohum Protein Profillerinin SDS-PAGE Yöntemiyle İle Belirlenmesi. S.Ü. Fen Edebiyat Fak. Fen Dergisi, 28: 117-122, ( 2006).
  • Chen L.F.O., Cheng M.C., Chen S.C.G. Similarity and diveristy of seed proteins in rice varieties. Botanical Bulletin of Academia Sinica, 28: 169–183, (1987).
  • Fujiwara, T., Nambarab E., Yamagishib K., Gotoc D. B., Naitoc , S. Storage Proteins. American Society of Plant Biologists, 1-12, (2002).
  • Ghafoor, A, Ahmad, Z, Qureshi, A.S, Bashir, M. Genetic relationship in Vigna mungo (L.) Hepper and V. radiata (L.) R. Wilczek based on morphological traits and SDS-PAGE. Euphytica, 123:367-378, (2000).
  • Ladizinsky G.W., Hymowitz T. Seed protein electrophoresis in taxonomic and evolutionary studies. Theoretical and Applied Genetics, 54: 680–685, (1979).
  • Sözen, Ö. Artvin ili yerel fasulye (Phaseolus vulgaris L.) populasyonlarının toplanması, tanımlanması ve morfolojik varyabilitesinin belirlenmesi. Yüksek lisans tezi, Ondokuz Mayıs Üniversitesi, Fen Bilimleri Enstitüsü, Samsun, sayfa 1, (2006).
  • Liang, X.Q., Luo, M., Holbrook, C.C., Guo, B.Z. Storage protein profiles in Spanish and runner market type peanuts and potential markers. BMC Plant Biology, 6:24, (2006).
  • Singh S.P., Nodari R., Gepts P. Genetic diversity in cultivated common bean I. allozymes. Crop Science, 31:19-23, (1991).
  • 0] Yupsanis T.M., Moustakes M., Karakoli S. Seed protein electrophoresis for varietal identification in rice (Oryza sativa L.), Journal of Agronomy and Crop Science, 168:95–99, (1992).
  • 1] Przybylska J., Zimniak-Przybylska Z., Krajewski P. Diversity of seed albumins in the grass pea (Lathyrus sativus): an electrophoretic study, Genetic Resources and Crop Evolution, 45: 423–431, (1998).
  • 2] Ertugrul, K., Arslan, E., Tugay, O. Characterization of Consolida S.F. Gray (Ranunculaceae) taxa in Turkey by seed storage protein electrophoresis. Turkish Journal of Biochemistry, 35(2);97-102, (2010).
  • 3] Tamkoc, A., Arslan, E. Comparison of Agronomic Characters, Total Seed Storage Proteins and Their Use For Genotypes Discrimination in the Kentucky Bluegrass (Poa pratensis L.), Biotechnology and Biotechnological Equipment, 24(1):1573-1576, (2010).
  • 4] Parisi, E., Agulari D., Methods Differentiating Meats of Different Species of Animals. “Biochemical İdentification of Meat Species” R.L.S. Patterson (Ed). Elselvier Applied Science Publishers Ltd., p. 40-49, England, (1985)
  • 5] Saraswati, R., Matoh, T., Phupaibul, P., Lumpkin, T.A., Kobayashi, M. Identification of Sesbania Species from Electrophoretic Patterns of Seed Protein, Tropical Agriculture (Trinidad), 70(3): 282-285, (1993).
  • 6] Laemmli, U.K., Cleavage of structural proteins during the Assembly of bacteriophage T4., Nature, 277:680-684, (1970).
  • 7] Nei, M. Estimation of average heterozygosities and genetic distances from a small number of individuals. Genetics 89:583-590, (1978) .
  • 8] Sammour, R.H., Radwan, S.A., El-Koly, A. Genetic diversity in Phaseolus spp. as revealed by SDS-PAGE markers. Plant Genetic Resources Newsletter, 151:69-75, (2007).
  • 9] Martins, S.R., Vences, F.J., Saenz de Miera, L.E., Barrosa, M.R., Carnide, V. RAPD Analysis of genetic diversity among and within Portuguese landraces of common white bean (Phaseolus vulgaris L.), Scientia Horticulturae, 108:133–142, (2006).
  • 0] Svetleva, D., Pereira, G., Carlier, J., Cabrita, L., Leitão, J., Genchev, D. Molecular characterization of Phaseolus vulgaris L. genotypes included in Bulgarian collecti on by ISSR and AFLP™ analyses. Scientia Horticulturae 109: 198–206, (2006).
  • 1] Papa, R., Gepts, P. Asymmetry of gene flow and differential geographical structure of molecular diversity in wild and domesticated common bean (Phaseolus vulgaris L.) from Mesoamerica. Theoretical and Applied Genetics, 106:239–250, (2003).
  • 2] Lioi, L., Piergiovanni A. R., Pignone, D., Puglisi, S., Santantonio, M., Gabriella S., Genetic diversity of some surviving on-farm Italian common bean (Phaseolus vulgaris L.) landraces. Plant Breeding. 124(6):576 – 581, (2005).
  • 3] Rosales-Serna, R., Herna´ndez-Delgado, S., Gonza´lez-Paz, M., Acosta-Gallegos, J.A., Mayek-Pe´rez, N. Genetic Relationships and Diversity Revealed by AFLP Markers in Mexican Common Bean Bred Cultivars, Crop Science, 45:1951-1957, (2005).
  • 4] Sicard, D., Nanni, L., Porfiri, O., Bulfon, D., Papa, R. Genetic diversity of Phaseolus vulgaris L. and P. coccineus L. landraces in central Italy. Plant Breeding, 124 :464-472, (2005).

Konya Bölgesinden Toplanan Phaseolus vulgaris (Leguminosae) Populasyonları Arasındaki Genetik Çeşitliliğin SDS-PAGE Yöntemi ile Belirlenmesi

Yıl 2010, Cilt: 2 Sayı: 35, 59 - 64, 01.12.2010

Elif Gülbahçe Buğra Özkubat Emine Arslan

Öz

Bu çalışmada Konya’nın ilçelerinden toplanan 17 Phaseolus vulgaris populasyonu arasındaki genetik çeşitliliğin SDS-PAGE ile belirlenmesi amaçlanmıştır. Tohum depo protein profilleri görsel şekilde var (1) ya da yok (0) olarak skorlanmıştır. On yedi Phaseolus vulgaris populasyonunda, 14.4 ve ~135 kDa arasında değişen farklı büyüklüklerde toplamda 37 polipeptit bant gözlenmiştir. Bio1D++ bilgisayar programında UPGMA kullanılarak kümeleme analizi yapılmıştır. Genotipler arasındaki benzerlik Nei’nin homolojisine dayanarak tahmin edilmiş ve bir dendrogram elde edilmiştir. Dendrograma göre Phaseolus vulgaris’e ait 17 populasyon %68-100 arasında değişen oranlarda benzer bulunmuştur. En yüksek benzerlik Kanada (Çumra) ve Sarnıç (Altınekin) genotipleri arasında bulunurken, en uzak genotip Sarhoş (Washington) (Derbent) olmuştur.

Anahtar Kelimeler

Phaseolus vulgaris Genetik çeşitlilik SDS-PAGE Tohum depo protein

Kaynakça

  • Babaoğlu, S., Açık, L., Çelebi, A., Adıgüzel, N. Molecular Analysıs Of Turkısh Alyssum L. (Brassıcaceae) Specıes By Rapd-Pcr And Sds-Page Methods. G.U. Journal of Science 17(3):25-33, (2004).
  • Beyazbenli, Ş., Dural, H., Arslan, E., Ertuğrul, K. Konya Bölgesindeki bazı Vicia L. (Leguminosae) Türlerinin Tohum Protein Profillerinin SDS-PAGE Yöntemiyle İle Belirlenmesi. S.Ü. Fen Edebiyat Fak. Fen Dergisi, 28: 117-122, ( 2006).
  • Chen L.F.O., Cheng M.C., Chen S.C.G. Similarity and diveristy of seed proteins in rice varieties. Botanical Bulletin of Academia Sinica, 28: 169–183, (1987).
  • Fujiwara, T., Nambarab E., Yamagishib K., Gotoc D. B., Naitoc , S. Storage Proteins. American Society of Plant Biologists, 1-12, (2002).
  • Ghafoor, A, Ahmad, Z, Qureshi, A.S, Bashir, M. Genetic relationship in Vigna mungo (L.) Hepper and V. radiata (L.) R. Wilczek based on morphological traits and SDS-PAGE. Euphytica, 123:367-378, (2000).
  • Ladizinsky G.W., Hymowitz T. Seed protein electrophoresis in taxonomic and evolutionary studies. Theoretical and Applied Genetics, 54: 680–685, (1979).
  • Sözen, Ö. Artvin ili yerel fasulye (Phaseolus vulgaris L.) populasyonlarının toplanması, tanımlanması ve morfolojik varyabilitesinin belirlenmesi. Yüksek lisans tezi, Ondokuz Mayıs Üniversitesi, Fen Bilimleri Enstitüsü, Samsun, sayfa 1, (2006).
  • Liang, X.Q., Luo, M., Holbrook, C.C., Guo, B.Z. Storage protein profiles in Spanish and runner market type peanuts and potential markers. BMC Plant Biology, 6:24, (2006).
  • Singh S.P., Nodari R., Gepts P. Genetic diversity in cultivated common bean I. allozymes. Crop Science, 31:19-23, (1991).
  • 0] Yupsanis T.M., Moustakes M., Karakoli S. Seed protein electrophoresis for varietal identification in rice (Oryza sativa L.), Journal of Agronomy and Crop Science, 168:95–99, (1992).
  • 1] Przybylska J., Zimniak-Przybylska Z., Krajewski P. Diversity of seed albumins in the grass pea (Lathyrus sativus): an electrophoretic study, Genetic Resources and Crop Evolution, 45: 423–431, (1998).
  • 2] Ertugrul, K., Arslan, E., Tugay, O. Characterization of Consolida S.F. Gray (Ranunculaceae) taxa in Turkey by seed storage protein electrophoresis. Turkish Journal of Biochemistry, 35(2);97-102, (2010).
  • 3] Tamkoc, A., Arslan, E. Comparison of Agronomic Characters, Total Seed Storage Proteins and Their Use For Genotypes Discrimination in the Kentucky Bluegrass (Poa pratensis L.), Biotechnology and Biotechnological Equipment, 24(1):1573-1576, (2010).
  • 4] Parisi, E., Agulari D., Methods Differentiating Meats of Different Species of Animals. “Biochemical İdentification of Meat Species” R.L.S. Patterson (Ed). Elselvier Applied Science Publishers Ltd., p. 40-49, England, (1985)
  • 5] Saraswati, R., Matoh, T., Phupaibul, P., Lumpkin, T.A., Kobayashi, M. Identification of Sesbania Species from Electrophoretic Patterns of Seed Protein, Tropical Agriculture (Trinidad), 70(3): 282-285, (1993).
  • 6] Laemmli, U.K., Cleavage of structural proteins during the Assembly of bacteriophage T4., Nature, 277:680-684, (1970).
  • 7] Nei, M. Estimation of average heterozygosities and genetic distances from a small number of individuals. Genetics 89:583-590, (1978) .
  • 8] Sammour, R.H., Radwan, S.A., El-Koly, A. Genetic diversity in Phaseolus spp. as revealed by SDS-PAGE markers. Plant Genetic Resources Newsletter, 151:69-75, (2007).
  • 9] Martins, S.R., Vences, F.J., Saenz de Miera, L.E., Barrosa, M.R., Carnide, V. RAPD Analysis of genetic diversity among and within Portuguese landraces of common white bean (Phaseolus vulgaris L.), Scientia Horticulturae, 108:133–142, (2006).
  • 0] Svetleva, D., Pereira, G., Carlier, J., Cabrita, L., Leitão, J., Genchev, D. Molecular characterization of Phaseolus vulgaris L. genotypes included in Bulgarian collecti on by ISSR and AFLP™ analyses. Scientia Horticulturae 109: 198–206, (2006).
  • 1] Papa, R., Gepts, P. Asymmetry of gene flow and differential geographical structure of molecular diversity in wild and domesticated common bean (Phaseolus vulgaris L.) from Mesoamerica. Theoretical and Applied Genetics, 106:239–250, (2003).
  • 2] Lioi, L., Piergiovanni A. R., Pignone, D., Puglisi, S., Santantonio, M., Gabriella S., Genetic diversity of some surviving on-farm Italian common bean (Phaseolus vulgaris L.) landraces. Plant Breeding. 124(6):576 – 581, (2005).
  • 3] Rosales-Serna, R., Herna´ndez-Delgado, S., Gonza´lez-Paz, M., Acosta-Gallegos, J.A., Mayek-Pe´rez, N. Genetic Relationships and Diversity Revealed by AFLP Markers in Mexican Common Bean Bred Cultivars, Crop Science, 45:1951-1957, (2005).
  • 4] Sicard, D., Nanni, L., Porfiri, O., Bulfon, D., Papa, R. Genetic diversity of Phaseolus vulgaris L. and P. coccineus L. landraces in central Italy. Plant Breeding, 124 :464-472, (2005).
Toplam 24 adet kaynakça vardır.

Ayrıntılar

Diğer ID JA58CB24PV
Bölüm Araştırma Makaleleri
Yazarlar

Elif Gülbahçe

Buğra Özkubat Bu kişi benim

Emine Arslan Bu kişi benim

Yayımlanma Tarihi 1 Aralık 2010
Gönderilme Tarihi 1 Aralık 2010
Yayımlandığı Sayı Yıl 2010 Cilt: 2 Sayı: 35

Kaynak Göster

APA Gülbahçe, E., Özkubat, B., & Arslan, E. (2010). Konya Bölgesinden Toplanan Phaseolus vulgaris (Leguminosae) Populasyonları Arasındaki Genetik Çeşitliliğin SDS-PAGE Yöntemi ile Belirlenmesi. Selçuk Üniversitesi Fen Fakültesi Fen Dergisi, 2(35), 59-64.
AMA Gülbahçe E, Özkubat B, Arslan E. Konya Bölgesinden Toplanan Phaseolus vulgaris (Leguminosae) Populasyonları Arasındaki Genetik Çeşitliliğin SDS-PAGE Yöntemi ile Belirlenmesi. sufefd. Aralık 2010;2(35):59-64.
Chicago Gülbahçe, Elif, Buğra Özkubat, ve Emine Arslan. “Konya Bölgesinden Toplanan Phaseolus Vulgaris (Leguminosae) Populasyonları Arasındaki Genetik Çeşitliliğin SDS-PAGE Yöntemi Ile Belirlenmesi”. Selçuk Üniversitesi Fen Fakültesi Fen Dergisi 2, sy. 35 (Aralık 2010): 59-64.
EndNote Gülbahçe E, Özkubat B, Arslan E (01 Aralık 2010) Konya Bölgesinden Toplanan Phaseolus vulgaris (Leguminosae) Populasyonları Arasındaki Genetik Çeşitliliğin SDS-PAGE Yöntemi ile Belirlenmesi. Selçuk Üniversitesi Fen Fakültesi Fen Dergisi 2 35 59–64.
IEEE E. Gülbahçe, B. Özkubat, ve E. Arslan, “Konya Bölgesinden Toplanan Phaseolus vulgaris (Leguminosae) Populasyonları Arasındaki Genetik Çeşitliliğin SDS-PAGE Yöntemi ile Belirlenmesi”, sufefd, c. 2, sy. 35, ss. 59–64, 2010.
ISNAD Gülbahçe, Elif vd. “Konya Bölgesinden Toplanan Phaseolus Vulgaris (Leguminosae) Populasyonları Arasındaki Genetik Çeşitliliğin SDS-PAGE Yöntemi Ile Belirlenmesi”. Selçuk Üniversitesi Fen Fakültesi Fen Dergisi 2/35 (Aralık 2010), 59-64.
JAMA Gülbahçe E, Özkubat B, Arslan E. Konya Bölgesinden Toplanan Phaseolus vulgaris (Leguminosae) Populasyonları Arasındaki Genetik Çeşitliliğin SDS-PAGE Yöntemi ile Belirlenmesi. sufefd. 2010;2:59–64.
MLA Gülbahçe, Elif vd. “Konya Bölgesinden Toplanan Phaseolus Vulgaris (Leguminosae) Populasyonları Arasındaki Genetik Çeşitliliğin SDS-PAGE Yöntemi Ile Belirlenmesi”. Selçuk Üniversitesi Fen Fakültesi Fen Dergisi, c. 2, sy. 35, 2010, ss. 59-64.
Vancouver Gülbahçe E, Özkubat B, Arslan E. Konya Bölgesinden Toplanan Phaseolus vulgaris (Leguminosae) Populasyonları Arasındaki Genetik Çeşitliliğin SDS-PAGE Yöntemi ile Belirlenmesi. sufefd. 2010;2(35):59-64.

Dergi Sahibi: Selçuk Üniversitesi Fen Fakültesi Adına Rektör Prof. Dr. Metin AKSOY
Selçuk Üniversitesi Fen Fakültesi Fen Dergisi temel bilimlerde ve diğer uygulamalı bilimlerde özgün sonuçları olan Türkçe ve İngilizce makaleleri kabul eder. Dergide ayrıca güncel yenilikleri içeren derlemelere de yer verilebilir.
Selçuk Üniversitesi Fen Fakültesi Fen Dergisi;
İlk olarak 1981 yılında S.Ü. Fen-Edebiyat Fakültesi Dergisi olarak yayın hayatına başlamış; 1984 yılına kadar (Sayı 1-4) bu adla yayınlanmıştır.
1984 yılında S.Ü. Fen-Edeb. Fak. Fen Dergisi olarak adı değiştirilmiş 5. sayıdan itibaren bu isimle yayınlanmıştır.
3 Aralık 2008 tarih ve 27073 sayılı Resmi Gazetede yayımlanan 2008/4344 sayılı Bakanlar Kurulu Kararı ile Fen-Edebiyat Fakültesi; Fen Fakültesi ve Edebiyat Fakültesi olarak ayrılınca 2009 yılından itibaren dergi Fen Fakültesi Fen Dergisi olarak çıkmıştır.
2016 yılından itibaren DergiPark’ta taranmaktadır.

88x31.png

Selçuk Üniversitesi Fen Fakültesi Fen Dergisi Creative Commons Atıf 4.0 Uluslararası Lisansı (CC BY-NC 4.0) ile lisanslanmıştır.